Das SLE wird von der Humboldt-Universität, vom Land Berlin (Senatsverwaltung für Wirtschaft, Technologie und Frauen) und vom Bundesministerium für Wirtschaftliche Zusammenarbeit und Entwicklung (BMZ) finanziert. Für die Durchführung der Auslandsprojekte und weiterer Gutachteraufträge akquiriert das SLE Drittmittel.